生物多样性与基因组学团队

一、团队介绍（300字左右）

长期从事长江中下游水生生物资源调查和监测，尤其近几十年来对鄱阳湖和赣江水生生物资源进行了持续调查和监测，积累了丰富资料和数据。近十年主持承担有关项目10多项，发表鄱阳湖和赣江的浮游植物、浮游动物和底栖动物论文20多篇。参与多项研究成果获奖，2019年获江西省科技进步一等奖：鄱阳湖科学考察。2020年获江西省科学技术进步奖三等奖：鄱阳湖流域湖泊净水渔业关键技术集成创新与示范。

二、团队成员简介

团队负责人

吴小平博士、教授、博士生导师。主要从事贝类分类及水域生态学。主持国家自然基金5项、国家重大研发课题1项、农业部行业948项目及专项等课题。省部级人才。兼职中国动物学会理事（2004--）；中国贝类学会副理事长(2007–)；江西省水产学会理事长(2017--)等。

团队成员

欧阳珊，教授、硕士生导师。主要从事陆生贝类分类、鱼类资源多样性及其保护生物学。主持国家自然基金2项，国家科技基础性工作专项重点项目专题、国家重点研发计划项目子课题各1项。兼职江西省水产学会常务理事、江西省动物学会理事、江西省生态学会理事。

周春花 博士、副教授、硕士生导师、校级人才。主要从事生物多样性研究。主持国家级、省部级各类项目10余项、发表SCI论文论文11篇、授权专利2项。获省科技进步及自然科学三等奖1项。主编及参编教材各1部。

黄晓晨 博士、讲师。南昌大学赣江青年学者，主要研究方向为系统进化与生物多样性，主持国家自然科学基金青年科学基金1项、江西省自然科学基金2项，在Molecular Phylogenetics and Evolution等国际学术期刊发表SCI论文10余篇。

团队合影


三、主要研究方向

1.贝类分类与基因组学

2.水生生物资源与保护

3.环境DNA技术

4.鱼类种质资源挖掘与利用

四、近三年（或五年）承担的主要项目

1.国家自然科学基金（2024-2026）：中国西南部干热河谷陆生贝类系统分类及多样性成因研究

2.江西省农业厅重大项目（2023-2026）：马口鱼联合育种及产业化推广应用

3.江西省水利厅项目（2023-2025）：水文节律对鄱阳湖浮游和底栖动物多样性的影响及环境DNA监测技术应用研究

4.江西省自然科学基金面上项目（2023-2026）：鄱阳湖流域淡水双壳类超级DNA条形码的构建及系统发育基因组学研究

5.国家自然科学基金青年项目（2022-2024）：基于基因组与几何形态学的中国特有华蛏蚌属分子系统学及物种分化研究.

6.江西省自然科学基金青年项目（2020-2022）：利用基因组浅层测序获取楔蚌属的父系与母系线粒体全基因组及物种分化研究

7.国家重点研发计划蓝色粮仓项目(2018-2022)课题：湖泊渔业生境退化与生物多样性格局演变机制。

8.国家自然科学基金面上项目(2018-2021)：中国蚌科系统发育及分类整理。

9.国家自然科学基金（2017-2020）罗霄山脉和武夷山脉陆生贝类分类、区系和物种多样性格局。

10.江西省农业农村厅（2021-2022）：江西部分重点水域水生生物资源监测。

11.中科院动物所横向项目（2014-2018）：动物标本标准化整理与数字化表达。

五、近三年（或五年）发表的主要论文、授权专利和出版著作、颁布标准等

  1. Yangtze finless porpoise (Neophocaena asiaeorientalis) prey fish diversity based on environmental DNA metabarcoding. Aquatic Conserv: Mar Freshw Ecosyst. 2023;33:784–797.

  2. Mitogenomic phylogeny resolves Cuneopsis (Bivalvia: Unionidae) as polyphyletic: The description of two new genera and a new species. Zoologica Scripta. 2022;51:173~184.

  3. Systematics, distribution, biology, and conservation of freshwater mussels (Bivalvia: Unionida) in China. Aquatic Conserv: Mar Freshw Ecosyst. 2022.1~37.

  4. Human-type and pig-type Ascaris hybrids found in pigs. Veterinary Parasitology, 2022, 302: 109646.

  5. Environmental DNA metabarcoding reveals the biological community structure in Poyang Lake, China. Conservation Genetics Resources, 2022, 14:437-448.

  6. Seasonal and spatial variability of zooplankton diversity in the Poyang Lake Basin using DNA metabarcoding. Ecology and Evolution, 2022.12(6): e8972.

  7. Community characteristics of phytoplankton and management implications in Poyang Lake Basin. Limnology,2021. 1~12.

  8. The role of anthropogenic habitats in freshwater mussel conservation. Global Change Biology. 2021,00:1~17.

  9. Changes and drivers of freshwater mussel diversity patterns in the middle and lower Yangtze River Basin, China. Global Ecology and Conservation. 2020. 22: e00998.

  10. Conservation status assessment and a new method for establishing conservation priorities for freshwater mussels (Bivalvia: Unionida) in the middle and lower reaches of the Yangtze River drainage. Aquatic Conservation Marine and Freshwater Ecosystems, 2020. DOI:10.1002/aqc.3298.

  11. Effects of dams and their environmental impacts on the genetic diversity and connectivity of freshwater mussel population in Poyang Lake Basin, China. Freshwater Biology. 2020. 65(2): 264~277 .

  12. Temporal and spatial changes in macrozoobenthos diversity in Poyang Lake Basin, China . Ecology and Evolution, 2019. 9 (11): 6353-6365.

  13. Towards a global phylogeny of freshwater mussels (Bivalvia: Unionida):Species delimitation of Chinese taxa, mitochondrial phylogenomics, and diversification patterns. Molecular Phylogenetics and Evolution.2019. 130:45~59.

  14. A novel gene arrangement among the Stylommatophora by the complete mitochondrial genome of the terrestrial slug Meghimatium bilineatum (Gastropoda, Arionoidea). Molecular Phylogenetics and Evolution.2019. 135: 177~184.

  15. 国家重点保护水生野生动物（编委）。中国农业出版社，2022.

  16. 罗霄山脉脊椎动物图鉴(欧阳珊主编)。科学出版社，2022.

  17. 罗霄山脉动物多样性编目(欧阳珊副主编)。科学出版社，2022.

  18. 罗霄山脉生物多样性综合科学考察(欧阳珊副主编)。科学出版社，2022.

  19. 周春花, 陈金萍, 吴小平, 欧阳珊, 黄晓晨. 一种蚌类环境DNA宏条形码引物、鉴定方法及应用, 专利号：ZL202110557931.1 授权日：2022-08-09.

  20. 周春花, 陈圆圆, 牛红艳. 猪蛔虫全基因组微卫星分子标记及其引物与应用，已授权, 专利号：ZL201811227969.7 授权日：2021-06-20.

六、学生培养与就业

1.学生培养：

5年来，培养博士研究生4人，在读3人；毕业硕士研究生15人，在读14人。武瑞文、刘雄军、谢广龙获江西省优秀博士论文；2019年以来薛涛涛、周幼杨、曹艳玲、郭琴、孙威威、陈旭等获江西省优秀硕士论文。

2.学生就业：

近5年，毕业博士研究学均在高校从事教学和科研工作，硕士研究生从事公务员、中学教师、环境监测和评价工作，部分同学继续攻读博士学位。

七、代表性成果

1. 代表性成果1

淡水及陆生贝类多样性及系统学研究。长江中下游是我国淡水和陆生贝类最丰富的地区，是东亚蚌类的分布中心。近十几年来，系统报告该地区贝类近400种，建立和发现一批贝类新属、新种；揭示了蚌科钩介幼虫在蚌科分类中意义，结合形态学特征和线粒体全基因组数据，厘清多个物种的分类位置，构建中国蚌科新的分类系统；阐明了长江流域蚌类多样性格局、濒危状况和影响因素，提出了保护对策。

2. 代表性成果2 

小型及珍稀特色鱼类规模化繁育与产业化示范。开展了乌醴、黄鳝、刺鲃、花（鱼骨）、蛇鮈、胭脂鱼、马口鱼等小型及珍稀特色鱼类人工繁育及产业开发技术研究，在江西最早突破小型鱼类驯化和人工繁殖技术（2000），突破胭脂鱼、乌醴苗种规模繁育和健康养殖模式难题，示范推广了多种有效的养殖模式和技术.获江西省科技进步三等奖、农业部丰收奖5项。

3. 代表性成果3

寄生线虫分子生态学及病原学调查研究。开展了寄生线虫的交配模式、基因组系统发育研究、种群遗传及比较基因组学研究，探讨了其分类地位及传播动力学，提出了有效的防控策略。利用环境DNA技术进行地区吸虫监测的病原学调查，特别是那些人类感染风险高的地区，在寄生虫病和病媒的监测和控制方面有潜在的应用前景。